Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip13Q3UA06 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms