Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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