Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U595 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U595 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U595 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U595 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U595 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U595 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U595 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U595 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U595 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms