Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VwceQ3U515 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms