Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms