Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr4Q3TQS0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms