Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms