Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms