Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms