Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms