Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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