Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms