Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms