Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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