Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rpusd2Q149F1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rpusd2Q149F1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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