Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms