Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd2Q0VBL1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd2Q0VBL1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms