Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms