Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SctQ08535 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SctQ08535 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SctQ08535 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SctQ08535 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SctQ08535 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SctQ08535 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SctQ08535 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SctQ08535 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SctQ08535 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SctQ08535 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SctQ08535 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SctQ08535 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SctQ08535 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SctQ08535 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms