Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MestQ07646 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MestQ07646 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MestQ07646 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms