Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms