Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms