Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sox12Q04890 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms