Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox8Q04886 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms