Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms