Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms