Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scg2Q03517 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms