Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl7Q03366 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms