Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms