Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms