Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GscQ02591 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GscQ02591 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GscQ02591 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GscQ02591 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GscQ02591 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GscQ02591 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GscQ02591 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms