Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms