Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
VcpQ01853 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms