Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms