Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms