Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms