Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms