Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms