Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms