Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms