Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms