Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb4P99026 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms