Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms