Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra1P97785 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra1P97785 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra1P97785 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra1P97785 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gfra1P97785 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra1P97785 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra1P97785 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra1P97785 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms