Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx2P97474 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms