Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms