Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp1P97350 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp1P97350 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp1P97350 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp1P97350 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms