Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms