Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms