Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctps1P70698 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms